هدف اصلی و عمده نشریه علمی روان شناسی قرآن بنیان، ایجاد یک بستر و محیط فکری برای به اشتراک گذاشتن جدیدترین دستاوردهای علمی و تحقیقاتی (بنیادی، توسعه‌ای و کاربردی) استادان، دانشجویان و پژوهشگران در حوزه روان شناسی قرآنی و اسلامی با رعایت دو اصل تولید دانش نظری- فنی و حرکت در مرز دانش و معطوف بودن موضوعات به حل یک مساله کلیدی در سطح بین‌المللی، ملی، منطقه‌ای و یا نهادی- سازمانی است. غنا بخشیدن به تولیدات حوزه روان شناسی اسلامی؛ ایجاد شبکه نخبگان و خبرگان این حوزه از میان نویسندگان مقالات نشریه؛ ارج نهادن به مطالعات و تحقیقات در حوزه تولیدمحتواهای روان شناسی از قرآن و منابع دینی و اسلامی ؛ مساله محور کردن تحقیقات و پژوهش‌ها از جمله سایر اهداف نشریه هستند.
از‌این‌رو، محورهای دارای اولویت نشریه عبارتند از:
- مبانی نظری روانشناسی و علوم تربیتی بر مبنای متون اسلامی و قران
- روش های پژوهش های قرآنی از منظر قرآن کریم و روایات اهل بیت علیم السلام
- انسان شناسی از منظر قرآن کریم و روایات اهل بیت علیم السلام
- رشد و تحول از منظر قرآن کریم و روایات اهل بیت علیم السلام
- مسایل اجتماعی از منظر قرآن کریم و روایات اهل بیت علیم السلام
- آسیب شناسی از منظر قرآن کریم و روایات اهل بیت علیم السلام
- سلامت از منظر قرآن کریم و روایات اهل بیت علیم السلام
- مشاوره و درمان از منظر قرآن کریم و روایات اهل بیت علیم السلام
- تعلیم و تربیت از منظر قرآن کریم و روایات اهل بیت علیم السلام
- زوجیت و خانواده از منظر قرآن کریم و روایات اهل بیت علیم السلام
- شخصیت از منظر قرآن کریم و روایات اهل بیت علیم السلام
- رسانه و ارتباطات از منظر قرآن کریم و روایات اهل بیت علیم السلام
- رزم و دفاع از منظر قرآن کریم و روایات اهل بیت علیم السلام